儘管確定了“南攻北守”的戰略方針，朱厚熜也不敢鬆懈，一個很嚴重的問題始終壓在他的心頭，就是日本問題.
從現在來看，日本正處在戰國時代，但是，火槍已經被汪直傳入日本種子島，這幾年裏不知道有沒有學會造“鐵炮”的能工巧匠離開種子島，讓“鐵炮”在日本遍地開花，汪直這一趟北上日本就能探出結果。不過，即便沒有，那些葡萄牙人如今在東方如此活躍，難免會插手同樣利潤不菲的中日貿易，跑一跑短途貿易打個短平快賺點快錢，那麼，“鐵炮”傳入日本就不可遏止，日本統一也就不可遏止；或許再過五十年，統一後的日本就註定會入侵朝鮮，明軍抗日援朝之壯舉也就註定會發生……
一言一蔽之，世界歷史還會按照他固有的軌道前進！
朱厚熜知道，作爲穿越回來當上了大明王朝嘉靖皇帝的他，或許可以改變中國的歷史，卻不見得能改變整個世界的歷史進程，除非他能象一力推行嘉靖新政一樣，做出能影響或是改變其他國家歷史進程的事情。遠隔重洋的歐洲一時還鞭長莫及，只能望洋興嘆；可對於一衣帶水的日本若是放任不管，就太對不起辛辛苦苦讓他穿越的命運之神、上帝之手了——要知道，打開時空之門一定很費功力很費能量，要不爲什麼除了網絡寫手這一特殊羣體，其他人怎麼就很少聽說能穿越回去啊？
因此，朱厚熜已經下定決心，剿滅倭寇，肅清海路之後，還是應該派些兵啊船啊什麼的到日本去轉一轉。
熱愛和平、一貫主張睦鄰友好的中華民族不是醜陋的歐洲野蠻人，當然不會搞殖民統治，更不可能搞種族滅絕。不過，聽說倭寇中間有不少人是受某些別有用心企圖破壞中日傳統友誼的戰國大名所指使，追究追究他們的領導責任也是可以的嘛！還有，在日本戰國初期的南北朝時代，無論是天皇還是室町幕府的足利將軍都曾經接受過我大明朝的冊封，是我們大明天朝上國認可的合法統治者，你們這些臣子不尊天皇和幕府將軍的號令，你打過來我打過去，象話嗎？聽說你們還動不動就搞什麼“上洛”（注1），身爲臣子，竟然一再以武力脅迫君上，企圖挾天子以令諸侯，我大明作爲日本的保護國，面對這樣大逆不道的舉動豈能坐視不管？只要天皇或室町幕府的足利將軍懇請我大明出兵“尊王攘夷”，我大明砸鍋賣鐵也要組建大明志願軍，以大無畏的國際主義精神，雄赳赳、氣昂昂，跨過日本海，用實際行動履行我們對藩屬之國的國際義務，匡扶人間正義，維護世界和平！
而且，趕集還得趁早，抗日援朝大概是在萬曆中期，嘉靖在位四十五年，距現在只剩下了二十年的時間，隆慶一朝只是六年，也就是說，從現在到萬曆中期，最多也不過五十年的光景，結束日本戰國時代的那幾位猛人：織田信長、豐臣秀吉、德川家康肯定都已經出生了，甚至，那個奠定日本統一基礎，卻沒有福氣去享受勝利成果的倒黴蛋織田信長或許已經成年了，時不我待啊！
爲此，朱厚熜在調汪直專跑東洋航線、經營中日海外貿易之時，專門給他下了一道密旨手札，密令他不惜一切代價蒐集日本國內政治、軍事、經濟等情報，重點放在日本天皇、室町幕府的足利將軍和各位有名有姓的戰國大名身上，還特別圈定了幾個有名的家族，按重要程度依次排列爲織田、德川、武田、今川、細川、毛利、上杉……
當然，這都是朱厚熜在另一個時空看閒書和玩《太閣立志傳》所殘留的一點記憶，難免掛一漏萬。當熟知日本情況，被朱厚熜戲稱爲“日本通”的汪直接到皇上密旨之後十分疑惑：若說關注武田、細川、今川、毛利這些佔有一國或幾國的戰國大名確乎緊要，皇上說起的織田、德川是誰啊？沒聽說過嘛！大概也就是佔據一兩座小城的小領主，怎麼還排到了已經在日本名滿天下、威震全國的武田家族前面了？莫非皇上又是“夢得神授”，知道這兩個家族日後會成爲我大明的威脅？若如此說來，倒確需早做謀劃，防患於未然。不管怎麼說，皇上天縱睿智，又是膺天明命的真龍天子，有上蒼護佑，時常能天人感應，他的決策，是斷不會錯的！
朱厚熜堅信，汪直當年曾將大規模殺傷性武器“鐵炮”販賣到日本，許多戰國大名都是他的VIP客戶，關係網密佈日本列島，可謂縱橫軍政兩界、通喫黑白兩道，蒐集情報自然小菜一碟、手到擒來。至於能不能說服日本天皇和室町幕府的足利將軍發出邀請函倒無關緊要，當年冊封他們的詔書、金印，大明王朝都留着副本；而他們奉上的國書、拜上的謝表也在皇史晟裏存檔，花上幾兩十兩銀子在北京琉璃廠找個造假的工匠，別說是能矇住明朝的官員，大概日本天皇和室町幕府的足利將軍本人也分辨不出真假。
若是單純只是一個日本問題，倒也好辦——不求佔據本土在日本實行殖民統治的話，只需要把那些有潛質統一日本的猛人幹掉，就能讓日本戰國時代打得更久一點更熱鬧一點，等於是在滾滾前進的日本歷史戰車的輪子底下墊上了一個小石子，輕輕一顛就能改變他們的歷史進程。但是，若是仔細衡量中國國情與軍事實力，再綜合考慮當前錯綜複雜的國際局勢，解決日本問題就不是那麼簡單了。
中國一直擁有世界上最先進的造船技術，自唐宋年間起，中國的船隊就曾劈波斬Lang，遠航大洋；連在馬背上長大的元太祖忽必烈都知道跨海遠征日本，只不過因爲造船的人偷工減料，造出的船隻質量不高，兩度毀於颱風，徵日大業才無功而返。可是，到了明朝，朱元璋那個農民竟然神經病地要禁海，其中雖有永樂年間鄭和七下西洋的壯舉，也不過是曇花一現，大部分的時候還是厲行禁海之策，所造成的一個直接的惡果就是明朝現在的造船能力大不如前，各處船場日夜趕工，也趕不上飛速發展的國際貿易和軍事建設的需要，前幾年建造的大戰船都已編入東海艦隊，這兩年造的已被朱厚熜命令全部用在膠東半島至遼東半島之間的海路運輸，一是熟悉周圍地理海情，隨時準備用於遠征日本；二來薊遼各鎮即將要合力圍剿長期威脅明朝東北邊境國防安全的兀良哈三衛和土蠻諸部，軍需糧秣供應任務十分繁重，爲此朝廷還專門設立了登萊巡撫衙門和軍糧轉運處衙門。
此外，明朝開國以來厲行海禁之策，還帶來了另外一個更爲嚴重的惡果，就是明軍根本就沒有可以適合遠洋作戰的海軍，好不容易用江防軍和漕軍拼湊起了一支東海艦隊，已是大明海軍的全部家底，經過剿滅倭寇實戰練兵，東海艦隊或許可以承擔起對日作戰的任務，如今已經來到東方佔據了馬六甲海峽等多處戰略要地的葡萄牙人、還有馬上就會來到東方的西班牙人若是趁火打劫，或是坐收漁翁之利，怎麼辦？他們的海軍可是已經能遠征亞洲、美洲的“藍水艦隊”啊！除了東海艦隊，哪裏再能拼湊起一支海軍應付南海戰事？
考慮再三，爲了避免實力薄弱的大明海軍不至於面臨兩面作戰的窘迫處境，爲了避免剛剛出襁褓的大明海軍不至於被萬惡的歐洲侵略者扼殺在搖籃之中，朱厚熜不得不做出艱難的決定：放棄對佛郎機商人徵收高額關稅的打算，改以提前實施“月之暗面”行動——在關稅上做文章，實行貿易壁壘容易引起葡萄牙人瘋狂的報復，斷絕大明王朝與西番諸國之間海上貿易這一大財源；甚至會給他們侵略的口實。爲了至少在解決日本問題之前安撫住葡萄牙人，還是應該避免採取這樣過激的行動，只要他們謹遵大明王朝律法，合法經商，照章納稅，給他們貿易最惠國甚至國民待遇都可以。
雖說這一決策符合“遠交近攻”這一代表中國最高外交智慧的歷史傳統，可是，做出這樣重大的讓步，依然讓朱厚熜覺得十分屈辱。
可是，國力如此，軍力如此，他又能有什麼好辦法呢？
注1：上洛：日本京都古城建築仿製唐朝的洛陽城和長安城，分爲東京、西京兩部分，東京仿洛陽，西京仿長安。鎌倉幕府時期，被稱爲“長安”的西京衰落，東京洛陽興盛，當時的日本人就把京都稱爲“洛陽”、“洛城”。“上洛”就是赴京都的意思，不過，戰國大名所謂“上洛”，則是武裝進軍並佔領京都，挾持天皇和幕府將軍號令天下，成爲戰國霸主。豐臣秀吉統一日本前，“上洛”是所有實力強大且有野心的戰國大名的畢生夢想，有“最強武將”之稱的武田信玄就因病死在“上洛”的路上；而織田信長的成名之戰“捅狹間之戰”也是狙擊企圖“上洛”的戰國大名今川義元。